14 février 2012

Notions de base en statistiques

Je mets à disposition en suivant le contenu d'un cours sur le rapppel de notions de base en statistique, cours que j'ai donné en France, dans le cadre du Master Toxicologie Environnement Santé de l'Université Paris 7.       L'ensemble du cours est accessible en ligne sous forme d'un diaporama en cliquant sur le lien suivant: Rappels de statistique    Vous pouvez aussi récupérer ce cours au format PDF, en cliquant sur le lien suivante: Rappels_statistique_EpiInfoVF      

23 janvier 2012

Test de fréquences de modalités dues au hasard

                                  Un médecin d'Abidjan en Côte d'Ivoire m'a demandé de lui indiquer un test pour savoir si "la différence de fréquence observée entre les modalités d'une variable n'est pas due au hasard". Il existe un test qui utilise la loi du Chi2 et qui s'appelle le test du Chi2 dit de conformité.   Le principe de ce test est de comparer les valeurs observées (le nombre de sujets présentant chaque modalité) avec les valeurs... [Lire la suite]
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22 juillet 2011

2.2 Comparaison de deux moyennes observées

Problématique On étudie un caractère quantitatif donné noté X (tension artérielle, glycémie, âge des personnes interrogées…), dans 2 populations notées P1 et P2. La moyenne (l'espérance) et la variance de X sont notées:μ1 et σ1² dans la population P1 ;μ2 et σ2² dans la population P2 .Les moyennes μ1 et μ2 sont inconnues, et elles sont estimées par x1 et x2 sur un échantillon d'individus (de taille n1 et n2)  tiré dans chaque population P1 et P2.Les variances σ1² et σ2² sont soit connues, soit inconnues et estimées... [Lire la suite]
14 juin 2011

2.1 Comparaison d'une moyenne observée avec une moyenne théorique

Problématique On étudie un caractère quantitatif donné (=variable aléatoire quantitative) noté X (exemple: tension artérielle, glycémie, âge des personnes interrogées…).On mesure ce caractère dans un échantillon d'individus de taille n tiré d'une population.Par ailleurs on a la moyenne (l'espérance) théorique de X dans une population de référence, notée μ0 et sa variance notée σ2 (écart type noté σ).La question est de savoir si la moyenne de X,  dans l'ensemble de la population d'où est issu notre échantillon, notée  μ, est... [Lire la suite]
12 mai 2011

1.3 Comparaison de plus de deux fréquences (test d'homogénéité)

Problématique On étudie un caractère donné noté A à k modalités ou événements (comme les niveaux de gravité d'une maladie, des doses d'exposition à un polluant…) notées A1, … Ai, …Ak, dans un nombre l d'échantillons d'individus notés E1, .. Ej,…El.On observe :Oij, le nombre d'individus présentant la modalité Ai dans l'échantillon Ej: La question est de savoir si les fréquences des modalités Ai entre chaque échantillon sont statistiquements égales (c'est l'hypothèse nulle H0 pour un test bilatéral) ou sont statistiquement différentes... [Lire la suite]
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29 avril 2011

1.2 Comparaison de deux fréquences observées

ProblématiqueOn étudie un caractère donné noté A (être malade, être exposé à un facteur de risque de maladie, avoir un symptôme…) dans deux populations d'individus notées G1 et G2.On observe :f1, la fréquence de la présence de A dans un échantillon d'individus de taille n1 tiré de la population G1; f2, la fréquence de la présence de A dans un échantillon d'individus de taille n2 tiré de la population G2.La question est de savoir si les fréquences de A de chaque population G1 et G2, notées p1 et p2 sont égales (c'est l'hypothèse nulle... [Lire la suite]
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16 avril 2011

1.1 Comparaison d'une fréquence observée à une fréquence théorique

Problématique: On étudie un caractère donné noté A (être malade, être exposé à un facteur de risque de maladie…).On observe la fréquence f de la présence de A dans un échantillon d'individus de taille n tiré d'une population.Par ailleurs on a la fréquence théorique de A dans une population de référence, notée p0.La question est de savoir si la fréquence de A, notée p, dans l'ensemble de la population d'où est issu notre échantillon, est égale à cette fréquence théorique p0 (c'est l'hypothèse nulle H0) ou si ces deux fréquences sont... [Lire la suite]
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14 avril 2011

Les tests de comparaison

Je commence une série de messages résumant les conditions d'applications des tests statistiques de base de comparaison de fréquences et de moyennes, et les tests d'indépendances, avec les commandes Epi Info permettant de réaliser ces tests, ou les fonctions du logiciel R à utiliser, lorsque le test ne peut se calculer avec Epi Info (cf message du 4 mars 2011 "R: un logiciel de statistique complémentaire d'Epi Info").   Sommaire: Comparaison de fréquences Comparaison d'une fréquence observée avec une fréquence théorique ... [Lire la suite]
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05 avril 2011

Les loi de probabilité usuelles utilisées en statistiques

Les principales lois de probabilité usuelles utilisées en statistiques sont, suivant le type de variable : Pour les variables discrètes qui ne peuvent prendre que des valeurs entières  (le nombre de malades, de personnes exposées…) La loi Hypergéométrique H(N,n,p) de paramètres : N: la taille de la population,n: la taille de l'échantillon prélevé dans la population,p: la proportion d'individus possédant le caractère étudié dans la population (proportion de malades, d'exposés….) La loi Binomiale B(n,p) pour modéliser... [Lire la suite]
04 mars 2011

R : un logiciel de statistique complémentaire d'Epi Info

Epi Info™ est un très bon programme pour créer des questionnaires, et saisir ensuite les données obtenues.Pour ce qui est des analyses statistiques, il propose toutes les analyses de base utilisées en épidémiologie, mais si on veut aller plus loin, un logiciel statistique complémentaire peut être utile.Parmi les logiciels de statistiques gratuits qui peuvent servir de complément à Epi Info™, deux me semblent particulièrement intéressants:Open Epi qui propose une sérire d'outils statistiques semblalbles à ceux du module Statcalc d'Epi... [Lire la suite]
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